在生物学实验中，同一抗体在不同条件下进行电泳等分析时，跑出来的分子量却不一样，常常会出现这样的事情。有以下几个方面因素：

1. 抗体本身的结构特点

抗体是具有4条多肽链的对称结构，包含2条较长、相对分子量较大的相同重链（H链）和2条较短、相对分子量较小的相同轻链（L链），链间由二硫键和非共价键联结形成一个由4条多肽链构成的单体分子 。抗体存在多种形式，除了常见的单体形式，还可以形成多聚体。比如，IgM抗体在体内通常以五聚体形式存在，而在某些实验条件下，其聚合状态可能发生改变，从五聚体解离成单体或其他聚合程度不同的形式。这种聚合状态的变化会直接影响其在电泳等分析中的迁移率，从而表现出不同的分子量。

2.翻译后修饰也会影响抗体分子量

抗体在细胞内合成后，会经历一系列的翻译后修饰过程，其中糖基化最为常见。不同的细胞表达系统，由于其自身的糖基化酶种类、活性以及细胞内环境等因素的差异，会导致抗体糖基化程度不同。

以在哺乳动物细胞和昆虫细胞中表达的同一抗体为例，哺乳动物细胞表达的抗体可能具有更复杂、多样化的糖基化修饰，而昆虫细胞表达的抗体糖基化程度相对较低。糖基化的差异会使抗体的分子量增加不同的程度，进而在电泳等实验中呈现出不同的分子量结果。此外，磷酸化、乙酰化等其他翻译后修饰方式，也在一定程度上改变抗体的电荷性质和分子大小，影响其在电场中的迁移行为，造成分子量测定的差异。

3.实验条件不同

3.1电泳缓冲液的成分和pH值对抗体的迁移有显著影响：不同的缓冲液配方会影响抗体分子所带的电荷数量和性质。例如，在pH值较高的缓冲液中，抗体分子带有更多的负电荷，迁移速度相对较快；而在pH值较低的缓冲液中，电荷数量和性质的改变使迁移速度发生变化，最终导致分子量测定结果出现偏差。

3.2样品处理过程：在制备样品时，还原剂的使用与否以及其浓度会影响抗体分子间二硫键的状态。如果二硫键没有被充分还原，抗体会以多聚体或部分折叠的形式存在，导致迁移异常。同时，样品的上样量如果过大，会造成电泳条带的扩散和拖尾现象，影响对分子量的准确判断。

3.3 凝胶的浓度和交联度也会对抗体的迁移产生影响：不同浓度的凝胶孔径大小不同，抗体在不同孔径的凝胶中迁移的阻力不同。一般来说，较高浓度的凝胶孔径较小，适合分离分子量较小的蛋白质或抗体；而较低浓度的凝胶孔径较大，更有利于分子量较大的抗体迁移。如果在实验中选择了不合适的凝胶浓度，就导致抗体迁移异常，出现分子量测定不准确的情况。

3.4 仪器设备的差异以及校准情况：不同品牌和型号的电泳仪、成像系统等设备，其性能参数和分辨率存在差异。而且，如果仪器没有定期进行校准和维护，也会影响实验结果的准确性，使得同一抗体在不同设备上跑出不同的分子量。

在进行实验时，我们需要充分考虑这些因素，尽可能优化实验条件，准确分析实验结果，以获得可靠的抗体分子量数据。